Виктория С.

Биоинформатик

Я начинающий биоинформатик с опытом работы в здравоохранении, что развило мои аналитические навыки и умение работать в команде. Прошла профессиональную переподготовку в области Data Science, освоив алгоритмы машинного обучения, библиотеки Python (numpy, pandas, sklearn, tensorflow, pytorch и др.) и применяя эти знания в проектах по анализу данных. Также я получила повышение квалификации на курсе "Анализ NGS-данных" в Бластим. Особый интерес для меня представляет анализ биологических и медицинских данных,  а также применение ИИ в биотехе.

С отличием закончила магистратуру по направлению "Вычислительная биология" в ТюмГУ, где углубила знания в Python, R, статистике, анализе данных, а также изучила анализ DNAseq, RNAseq, scRNAseq, метагеномных данных, филогенетику, генетику и геномику популяций, структурную биоинформатику и другие дисциплины, необходимые биоинформатику. Моя магистерская диссертация посвящена разработке пайплайна для анализа данных DNAseq с целью оценки полигенных рисков пациентов с дислипидемиями.

На данный момент ищу удаленную позицию Intern/Junior биоинформатика/ученого по данным/ML-разработчика.

Постоянно получаю новые знания на Stepik, Duolingo и других платформах.

GitHub: https://github.com/ViViSpiro

Stepik: https://stepik.org/users/366744150/profile

Telegram: @ViViSpiro

E-mail: scientia@vivispiro.ruscientiavivispiro@gmail.com

Последнее обновление резюме 08.10.2025
Адрес г. Тверь, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ООО "АНКОР Финтех"
Асессор
Окт 2021 - Дек 2022
* Проводила анализ и оценку больших объемов данных (поисковой выдачи) на предмет их релевантности и полезности для пользователей, что развило навыки работы с информацией и ее интерпретации.

* Тестировала качество работы поисковой системы, выявляя ошибки и предлагая улучшения, что требовало аналитического подхода и внимания к деталям.

* Оценивала и фильтровала контент на основе заданных критериев (запрещенные материалы, возрастные ограничения, технические ошибки), что развило навыки работы с классификацией данных и их проверкой на соответствие стандартам.

* Анализировала пользовательский опыт, выявляя факторы, ухудшающие взаимодействие с сайтами (назойливая реклама, избыток ссылок, ошибки типа "404 Not Found").

* Работала с большими массивами информации, систематизируя и структурируя данные для дальнейшего анализа.

Образование

Бластим
Повышение квалификации "Анализ NGS-данных"
Янв 2025 - Фев 2025
Изучила контроль качества, анализ данных WGS и WES, определение гаплогруппы образцов по Y и MT, основы филогенетического анализа, сборку геномов и транскриптомов, анализ РНК-секвенирования, биоинформатическую обработку нанопоровых прочтений на примере метагеномных данных, анализ метилирования ДНК и анализ данных секвенирования единичных клеток (scRNA-Seq и snRNA-Seq), а также выполнила выпускной проект "Анализ экзома" (размещен на github). Вся практика выполнялась на удаленном сервере на базе Linux.
Бластим
"Экспресс Linux для NGS"
Янв 2025 - Янв 2025
Обновила знания, научилась работать на удаленном сервере.
Бластим
Повышение квалификации "Ученый будущего: интеграция AI в научную работу"
Дек 2024 - Дек 2024
Изучила работу промт-инженера. Выполнила проект "Auto-ML" с помощью Julius.AI.
Тюменский государственный университет
Биология: Вычислительная биология (магистр)
Сен 2023 - Текущий
Учусь дистанционно (очно). Средний балл: 5.0. Тема ВКР: "Пайплайн DNAseq для комплексной оценки рисков пациентов с дислипидемиями". Углубила знания в Python, R, статистике и английском языке, изучила анализ данных DNAseq, RNAseq, scRNAseq, анализ метагеномных данных, филогенетику, генетику и геномику популяций, структурную биоинформатику и другие дисциплины, необходимые биоинформатику.
GeekBrains
Data Science в медицине
Май 2022 - Окт 2024
Прошла курсы по Python, Git, Linux, алгоритмам анализа данных, линейной алгебре, математическому анализу, теории вероятности и математической статистике, изучила библиотеки для анализа данных, библиотеки для нейронных сетей, основы баз данных на примере MySQL, введение в R, введение в биоинформатику, а также статистику. Выполнила около 140 домашних заданий и около 20 курсовых проектов, а также прошла итоговую аттестацию.
Тверской медицинский колледж
Сестринское дело
Сен 2016 - Июл 2019
Тверской государственный университет
Психология (бакалавр психологии)
Сен 2006 - Июл 2010

В чем вы сильны?

НАВЫКИ

Функциональная экспертиза:

Биоинформатика: Разработка и валидация биоинформатических пайплайнов (DNA-seq), статистический анализ данных, оценка полигенного риска (PRS), интерпретация генетических вариантов, анализ NGS-данных (WGS, WES, RNA-seq, scRNA-seq, эпигенетические данные, метагеномные данные, сборка de novo), определение гаплогрупп по Y хромосоме и MT геному, проверка родства образцов.

Data Science в медицине: Разведочный анализ (EDA), статистическое тестирование, классическое машинное обучение, обработка естественного языка (NLP), компьютерное зрение (CV) данными и изучаю методы анализа аудио (распознавание речи).

Data Engineering: Написание SQL-запросов, разработка витрин, CTE, оконные функции, проектирование и разработка ETL-пайплайнов, парсинг сложных данных (PDF), работа с СУБД (PostgreSQL, SQLite, MySQL), интеграция с векторными БД, системы логирования.

Разработка на Python: Автоматизация процессов, создание телеграм-ботов, работа с API.

 

 

Индустриальная экспертиза:
HealthTech / Digital Health, разработка AI-продуктов для медицины и биологии, биоинформатика и геномика, инженерия данных для научных и образовательных проектов.

 

 

Инструменты:
Рабочее окружение и менеджмент пакетов:

Anaconda/Miniconda: Управление виртуальными окружениями и пакетами.

Биоинформатика и Анализ NGS-данных:

Языки: Python (BioPython, Pandas, NumPy, scipy, cyvcf2, shiny), R (tidyverse, Bioconductor, ggplot2), Bash.

Пайплайны и инструменты анализа: FastQC, MultiQC, fastp, BWA, Samtools, BCFtools, bedtools, GATK, Plink.

Форматы данных: FASTQ, BAM/CRAM, VCF/BCF, BED, GFF/GTF.

Базы данных и ресурсы: gnomAD, ClinVar, dbSNP, NCBI RefSeq, UCSC Genome Browser, ENSEMBL.

 

Data Science, Machine Learning и AI:

Основные библиотеки Python: Scikit-learn, Pandas, NumPy, SciPy, Matplotlib, Seaborn, Plotly, scipy, asyncio, aiogram, openai.

Обработка естественного языка (NLP): re, NLTK, Transformers (Hugging Face).

Компьютерное зрение (CV): OpenCV.

Фреймворки для развертывания моделей: FastAPI, Flask.

 

Data Engineering и Базы Данных:

Языки: Python (Psycopg2, sqlite3, requests, logging, dotenv), SQL, PL/pgSQL.

Базы данных: PostgreSQL, MySQL, SQLite

Векторные базы данных: PostgreSQL с расширением pgvector

ETL/Инженерия данных: Apache Airflow (логический следующий шаг), Pandas для ETL-процессов

Парсинг и работа с документами: PyPDF2, urllib

Инструменты: DBeaver, pgAdmin, VS Code, Jupyter Notebook, Git

 

Облачные платформы:

Изучаемые/базовые навыки: Docker, Apache Spark

 

 

Английский язык: B2.