Olga P.

Биоинформатик в области scRNA-seq, spatial transcriptomic 10x, machine learning

С моим опытом в области биоинформатики и анализа данных, я готова удаленно предоставить вам экспертную поддержку в работе с данными, включая данные NanoString и NGS. 

Моя специализация включает анализ транскриптомики, протеомики, и методы пространственной транскриптомики.

Чем я могу помочь:

  • Анализ Ваших данных: NanoString Sprint и NGS (scRNA-seq), протеомики поверхностных белков, ATAC-seq) единичных клеток как 10X Chromium, так и BD Rhapsody, и данных пространственной транскриптомики (10X Visium / GeoMX DSP);
  • Консультирование по подготовке и проведению NanoString Sprint, scRNA-seq и пространственных транскриптомных экспериментов;
  • Обучение Ваших специалистов анализу данных и постановке экспериментов указанных выше.

Владею Seurat v5, в том числе WNN, CellChat, pySCENIC, Monocle, scanpy, squidpy, keras.

Языки: R, Python.

Если чего-то нет в списке моих навыков - готова при надобности освоить и применить в работе!

Последнее обновление резюме 12.12.2023
Адрес Новосибирск, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Образование


Новосибирский Государственный Университет
Сен 2016 - Июн 2018
Факультет естественных наук
Кафедра - Молекулярная биология и биотехнология

Сибирский Федеральный Университет
Сен 2012 - Июн 2016
Факультет - Биология
Кафедра - Биофизика

В чем вы сильны?

Благодаря более чем 8-летнему опыту работы в различных областях (биофизика, молекулярная биология, вирусология, иммунология) я имею возможность смотреть на задачи с разных ракурсов и обладаю широким набором инструментов для реализации самых смелых исследовательских идей!

Сухие навыки:

  • Анализ и визуализация данных. Разработка уникальных скриптов под конкретные задачи.

Мокрые навыки:

  • scRNA-seq, Bulk RNA-seq, NanoString, RT-qPCR, пространственная транскриптомика 10x genomics
  • Методы молекулярной биологии
  • Методы вирусологии (+ разработка наборов ИФА на ВГС)
  • Основные методы микробиологии (+ получение, выделение и характеристика люминесцентных белков)

Область текущих рабочих интересов: иммунологические патологии и их лечение, фундаментальные исследования в области иммунологии.

Сфера моих интересов: регенерация и неинвазивные методы лечения и решение сложных проблем.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации: https://orcid.org/0000-0003-4911-1994
Рабочая почта: perik.zavodskaia@gmail.com
LinkedIn: https://www.linkedin.com/in/olga-perik-zavodskaia-348729b9/