Дарья Г.

Junior биоинформатик
Ищу работу биоинформатика (NGS анализ, Структурная биоинформатика) на начальные позиции или стажировку. Интересно было бы делать именно data mining из биологических данных.
Последнее обновление резюме 24.01.2024
Адрес Санкт-Петербург, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

НЦМУ имени Алмазова, Группа «Трансляционная онкология»
Лаборант-исследователь
Сен 2021 - Мар 2023
Одна из основных задач - исследование клеточной подвижности клеток рака глиобластомы.
Использованные мной методы:
- культивирование
- ИФА
- конфокальная и прижизненная микроскопия
- обработка микрофотографий (и видео) в программной среде ImageJ
- постобработка экспериментальных данных и статистическая обработка в R

Также писала отчёты по результатам работы и научные статьи.
Институт цитологии РАН, Группа «Биоресурсная коллекция культур клеток позвоночных»
Стажер-исследователь
Дек 2019 - Май 2021
Исследование изменения регуляции актинового цитоскелета на разных стадиях репликативого старения мезенхимных стволовых клеток.
Использованные мной методы:
- культивирование
- элетрофорез и вестерн-блот
- ИФА
- конфокальная микроскопия
- обработка микрофотографий (и видео) в программной среде ImageJ

Исследование Ca2+ сигналлинга в модели болезни Альцгеймера на трансформированных клетках.
Использованные мной методы:
- измерение Ca2+ сигналлинга в клетках с помощью кита для детекции уровня Ca2+ и специальной установки на основе микроскопа
- вестерн-блоттинг, электрофорез
- программная обработка экспериментальных результатов (ImageJ, Origin)

Образование

ТГУ
Программа переподготовки по биоинформатике
Сен 2023 - Текущий
Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург
Магистратура, Биофизика
Сен 2019 - Июн 2021
Санкт-Петербургский политехнический университет Петра Великого, Санкт-Петербург
Бакалавриат, Биохимическая физика
Сен 2015 - Июн 2019

В чем вы сильны?

- Есть опыт работы с языком R: преобразование табличных данных, статистическая обработка, построение графиков ggplot2.
С помощью специальных библиотек в R собирала характеристики клеточного движения из размеченных клеточных треков, которые были получены из данных микроскопии; проводила базовый статистический анализ на выявление различий между группами; строила регрессию; проводила PCA анализ.
- Владею базовым Python (основы + numpy, pandas, matplotlib, seaborn, JupyterLab).
- Ориентируюсь в командной строке Linux на уровне, достаточном, чтобы пользоваться биоинформатическии программами с возможностью настройки окружения (для устранения проблем с совместимостью).
- Имею представление об основных программах структурной биоинформатики (Pymol, AutoDock) и программах для работы с данными NGS (fastqc, samtools, spades, blast и т.д.).

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Мой профиль в ResearchGate:
https://www.researchgate.net/profile/Daria-Goncharova-2/research

telegram: @daria_gfs