Екатерина Ш.

Биоинформатик, молекулярный биолог

Ищу работу в качестве клинического биоинформатика

Рассматриваю релокацию и командировки 

Последнее обновление резюме 14.03.2024
Адрес Novi Sad, Serbia
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано
Соцсеть или сайт Заблокировано

Опыт

ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора
Младший научный сотрудник
Окт 2018 - Ноя 2022
Занималась получением модифицированных векторов на основе аденоассоциированных вирусов 1, 2 и 9 серотипов. Изучала возможность редактирования ИПСК моделей синдрома ломкой Х-хромосомы с использованием технологии CRISPR/Cas9. Получала трансгенные линии клеток.
Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН
Лаборант-исследователь
Фев 2017 - Июн 2017
Выполняла молекулярно-цитогенетические исследования образцов пациентов с диагнозом синдром ломкой Х-хромосомы. Занималась иммортализацией первичных линий клеток B-лимфоцитов. Анализировала кариотип пациентов и выполняла поиск специфичных маркеров с использованием флуоресцентной in situ гибридизации.

Образование

Институт Биоинформатики
Программа переподготовки по биоинформатике для биологов
Сен 2023 - Текущий
ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора
Аспирантура (Молекулярная биология)
Окт 2019 - Янв 2023
Тема исследования: Создание рекомбинантных векторов на основе аденоассоциированных вирусов с повышенной тропностью к клеткам-мишеням
Новосибирский Государственный Медицинский Университет
Ординатура (Неврология)
Сен 2017 - Июл 2019
Диплом с отличием (GPA: 5.0)
Новосибирский Государственный Университет
Лечебное дело
Сен 2011 - Сен 2017
Диплом с отличием (GPA: 4.8)

В чем вы сильны?

Я являюсь специалистом в области молекулярной биологии и биоинформатики. Долгое время я была связана с генной инженерией и самостоятельно выполняла проекты от этапов молекулярного клонирования до работ с культурами клеток. 

На данный момент я обучаюсь в Институте Биоинформатики по программе "Биоинформатика для биологов". Свободно владею такими языками программирования, как Python, R и bash. Работаю с Git. Имею навык работы с NGS-данными. Знакома с основами статистического анализа и машинного обучения.

Свободно владею английским языком. По данным Google Scholar мой h-индекс составляет 4. 

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Публикации за последние 5 лет:

  1. Shitik E.M., Velmiskina A.A., Dolskiy A.A., Lemskaya N.A., Maksimova Y.V., Shorina A.R., Graphodatsky A.S., Yudkin D.V. Reactivation of FMR1 gene expression is a promising strategy for fragile X syndrome therapy. // Gene Therapy, V. 27, PP. 247–253, 2020. DOI: 10.1038/s41434-020-0141-0
  2. Gridina M.M., Orlova P.A., Minina J.M., Shitik E.M., Lemskaya N.A., Grishchenko I.V., Dolskiy A.A., Shorina A.R., Maksimova Y.V., Yudkin D.V., Serov O.L. Establishment of an induced pluripotent stem cell line (ICGi026-A) from peripheral blood mononuclear cells of a patient with fragile X syndrome. // Stem cell research, V. 49, 102070, 2020. DOI: 10.1016/j.scr.2020.102070
  3. Grishchenko I.V., Tulupov A.A., Rymareva Y.M., Petrovskiy E.D., Savelov A.A., Korostyshevskaya A.M., Maksimova Y. V., Shorina A.R., Shitik E.M., Yudkin  D.V. A transgenic cell line with inducible transcription for studying (CGG)n repeat expansion mechanisms. // Vavilov Journal of Genetics and Breeding, V.25, N.1, PP. 117-124, 2021. DOI: 10.18699/VJ21.014
  4. Gridina M.M., Shitik E.M., Lemskaya  N.A., Minina J.M., Grishchenko I.V., Dolskiy A.A., Shorina A.R., Maksimova Y.V., Yudkin D.V. Derivation of iPS cell line (ICGi032-A) from a patient affected with fragile X syndrome. // Stem Cell Research, V. 57, 102615, 2021. DOI: 10.1016/J.SCR.2021.102615
  5. Dolskiy A.A, Gudymo A.S., Taranov O.S., Grishchenko I.V., Shitik E.M., Prokopov D. Y., Sobolevskaya E.V., Bodnev S.A., Danilchenko N.V., Moiseeva A.A., Torzhkova P.Y., Bulanovich Y.A., Onhonova G.S., Bruter A.V., Kubekina M.V., Soldatov V.O., Tregubchak T.V., Ryzhikov A.B., Gavrilova E.V., Maksyutov R.A., Deykin A.V., Yudkin, D.V. Distribution of SARS-CoV-2 after intranasal infection in transgenic mice with inducible ubiquitous expression of hACE2. // Frontiers in Molecular Biosciences, V. 8,821506, 2021. DOI:10.3389/fmolb.2021.821506
  6. Shitik E.M., Shalik I.K., Yudkin, D.V. AAV- based vector improvements unrelated to capsid protein modification. // Frontiers in Medicine, V. 10,1106085, 2023. DOI: 10.3389/fmed.2023.1106085