Дмитрий С.

молекулярный биолог (к.б.н.)

Хотелось бы поучаствовать в разработке какого-нибудь нового направления или проекта, лучше с выходом на прикладное использование.

Последнее обновление резюме 25.08.2017
Адрес Москва, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

ИМБ РАН (Москва)
научный сотрудник
Окт 2009 - Текущий
Лаборатория эпигенетических механизмов регуляции экспрессии генов

Образование


Московский государственный университет им. М.В.Ломоносова
Сен 1998 - Июл 2003
Кафедра Биоорганической химии (диплом с отличием).

В чем вы сильны?

Люблю свою работу, особенно работать в команде. В остальном современная молекулярная биология превратилась в конструктор из китов, так что обсуждать владение методами можно лишь условно. Больше работал с нуклеиновыми кислотами, а именно с репортерными конструкциями, позволяющими изучать транзиентную экспрессию под контролем различных регуляторных элементов генома. Анализ полученных данных с помощью СhIP-seq, глубокого секвенирования (NGS) и ПЦР в реальном времени.

 

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Руководство грантами:

РФФИ 16-04-01547-a
РФФИ 12-04-01311-а
Совет по грантам Президента Российской Федерации МК-1934.2014.4

 

  1. Kretova OV, Chechetkin VR, Fedoseeva DM, Kravatsky YV, Sosin DV, Alembekov IR, Gorbacheva MA, Gashnikova NM, Tchurikov Analysis of variability in HIV-1 subtype A strains in Russia suggests a combination of deep sequencing and multi-target RNA interference for silencing of the virus. AIDS Res Hum Retroviruses. 2017 Feb;33(2):194-201. doi: 10.1089/AID.2016.0088.
  2. Tchurikov NA, Yudkin DV, Gorbacheva MA, Kulemzina AI, Grischenko IV, Fedoseeva DM, Sosin DV, Kravatsky YV, Kretova OV. Hot spots of DNA double-strand breaks in human rDNA units are produced in vivo. Sci Rep. 2016 May 10;6:25866. doi: 10.1038/srep25866.
  3. Tchurikov NA, Fedoseeva DM, Gashnikova NM, Sosin DV, Gorbacheva MA, Alembekov IR, Chechetkin VR, Kravatsky YV, Kretova OV. Conserved sequences in the current strains of HIV-1 subtype A in Russia are effectively targeted by artificial RNAi in vitro.Gene. 2016 May 25;583(1):78-83. doi: 10.1016/j.gene.2016.03.001. Epub 2016 Mar 3.
  4. Tchurikov NA, Fedoseeva DM, Sosin DV, Snezhkina AV, Melnikova NV, Kudryavtseva AV, Kravatsky YV, Kretova OV. Hot spots of DNA double-strand breaks and genomic contacts of human rDNA units are involved in epigenetic regulation. J Mol Cell Biol. 2015 Aug;7(4):366-82. doi: 10.1093/jmcb/mju038. Epub 2014 Oct 3.
  5. Сосин Д.В., Кретова О.В., Кравацкий Ю.В., Чуриков Н.А. Анализ контактов концевой области форум домена в клетках S2 дрозофилы.  2013. Доклады Академии Наук, 452 (5), 259-263 doi: 10.1134/S1607672913050141.
  6. NA Tchurikov, OV Kretova, DM Fedoseeva, DV Sosin, SA Grachev, MV. DNA Double-Strand Breaks Coupled with PARP1 and HNRNPA2B1 Binding Sites Flank Coordinately Expressed Domains in Human Chromosomes. 2013. PLoS genetics 9 (4), doi: 10.1371/journal.pgen.1003429, e1003429.
  7. Vladimir A. Mitkevich Olga V. Kretova, Irina Yu. Petrushanko, Ksenia M. Burnysheva, Dmitry V. Sosin, Olga V. Simonenko, Olga N. Ilinskaya, Nickolai A. Tchurikov, Alexander A. Makarov. Ribonuclease binase apoptotic signature in leukemic Kasumi-1 cells 2013. Biochimie, 95, 1344-1349, doi: 10.1016/j.biochi.2013.02.016.
  8. Tchurikov N.A., Kretova O.V., Sosin D.V., Zykov I.A., Zhimulev I.F., Kravatsky Y.V. Genome-wide profiling of forum domains in Drosophila melanogaster. Nucleic Acids Res. 2011, 39(9), 3667-3685, doi: 10.1093/nar/gkq1353.
  9. Сосин Д.В., Моисеева Е.Д., Чуриков Н.А. Исследование дистантных взаимодействий LCR из локуса cut Drosophila melanogaster. ДАН 2010, 432, 127–130.
  10. Tchurikov, N.A. and Kretova, O.V, Moiseeva E.D., Sosin D.V. Evidence for RNA synthesis in the intergenic region between enhancer and promoter and its inhibition by insulators in Drosophila melanogaster. Nucl. Acids Res. 2009, 37, 111-122.
  11. Чуриков Н.А., Сосин Д.В., Кретова О.В., Моисеева Е.Д. Функциональный анализ последовательностей LCR из локуса cut дрозофилы. ДАН 2007, 415, 217-221
  12. Tchurikov N.A., Sosin D.V., Kretova O.V. The identification of a silencer element in the cut locus of Drosophila melanogaster located 73 and 96 kb upstream from the promoters of the locus. Drosophila Information Service 2006, 89, pp. 3-7.
  13. Tchurikov N.A., Sosin D.V., Petyovka N.V. Role of Paramyosin B (PrmB) in organization of dynamic chromosomal structures and transcription: binding of PrmB within locus control region of D. melanogaster cut locus. The FASEB Journal, 2006, v. 20, № 4, 466.
  14. Сосин Д.В., Кретова О.В., Чуриков Н.А. Изучение локусконтролирующего района (LCR)  локуса cut дрозофилы с помощью репортерных конструкций, экспрессирующих  люциферазу. ДАН 2006, 409, 832-836.
  15. Коваленко Т.Ф., Ванюшева О.В., Шилов И.А., Сосин Д.В., Суховерхова А.С. и др. Промоторы генов MTHFR при гипергомоцистеинемии и PTEN при злокачественных и доброкачественных опухолях эндометрия и яичников. Биоорганическая химия 2006, 32(4):414-423.