Я являюсь специалистом по молекулярному моделированию, младшим научным сотрудником в отделе биокинетики НИИ физико-химической биологии им. Белозерского МГУ. Закончила школу с золотой медалью, факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ – без троек (средний балл 4,7). В 2019 году закончила аспирантуру того же факультета и этой осенью планирую защищать кандидатскую диссертацию. С 2011 года я работаю в одной лаборатории под руководством Д.К. Нилова и В.К. Швядаса, где занимаюсь разработкой лекарственных соединений – ингибиторов ферментов – с использованием методов биоинформатики и молекулярного моделирования.

В своей работе я использую методы молекулярного докинга, скрининга, молекулярной динамики, такие программы, как ACD/ChemSketch, ACD/SpectrusDB, ACD/Percepta, VMD, LeadFinder, AmberTools (antechamber, tleap, ptraj), Amber (sander), а также пишу скрипты на языке Perl. Недавно я закончила работу над крупным проектом – программой структурной фильтрации результатов докинга для отбора лигандов по наличию специфичных взаимодействий с мишенью: https://biokinet.belozersky.msu.ru/vsfilt/ (бэкенд полностью). Также имею базовые навыки Python, HTML, CSS, PostgreSQL, Git и сейчас занимаюсь укреплением этих знаний.

С 2018 по 2020 год я руководила грантом Российского фонда фундаментальных исследований для молодых учёных, а также являюсь исполнителем ряда других грантов. В мои обязанности входит, в том числе: составление финансовых и научных отчётов, перевод отчётов и статей на английский язык (я имею сертификат переводчика научной литературы), создание презентаций и постеров в MS PowerPoint, представление результатов работ на конференциях, закупка реактивов и т.д. Я перфекционист, люблю порядок и планирование, всегда приветлива, исполнительна и открыта к любым предложениям. 

Список публикаций:

1. Gushchina I., Polenova A., Suplatov D., Švedas V., and Nilov D. (2020) vsFilt: A tool to improve virtual screening by structural filtration of docking poses. Journal of Chemical Information and Modeling, 60, 3692-3696, IF 4.549, квартиль Q1.
2. Нилов Д.К., Пушкарев С.В., Гущина И.В., Манасарян Г.А., Кирсанов К.И., Швядас В.К. (2020) Моделирование фермент-субстратных комплексов поли(ADP-рибозо)полимеразы 1 человека. Биохимия, 85, 116-125, IF 1.978.
3. Нилов Д.К., Гущина И.В., Щербакова Т.А., Балдин С.М., Швядас В.К. (2019) Применение фурансульфонатов для ингибирования транскетолазы патогена Mycobacterium tuberculosis. Патент RU2703465 C1.
4. Dyrkheeva N., Luzina O., Filimonov A., Zakharova O., Ilina E., Zakharenko A., Kuprushkin M., Nilov D., Gushchina I., Švedas V., Salakhutdinov N., and Lavrik O. (2019) Inhibitory effect of new semisynthetic usnic acid derivatives on human tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1. Planta Medica, 85, 103-111, IF 2.687, квартиль Q1.
5. Gushchina I., Švedas V., and Nilov D. (2018) Selection of bifunctional tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors by molecular modeling. FEBS open bio, 8, Supplement S1, 455-455, IF 2.231.
6. Нилов Д.К., Яшина К.И., Гущина И.В., Захаренко А.Л., Суханова М.В., Лаврик О.И., Швядас В.К. 2,5-Дикетопиперазины: новый класс ингибиторов поли(ADP-рибозо)полимеразы (2018) Биохимия, 83, 251-258, IF 1.978.
7. Гущина И.В., Нилов Д.К., Захаренко А.Л., Лаврик О.И., Швядас В.К. (2017) Моделирование структуры и скрининг ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы 1 человека. Acta Naturae, 9, 62-69, IF 1.360.
8. Zakharenko A., Luzina O., Koval O., Nilov D., Gushchina I., Dyrkheeva N., Švedas V., Salakhutdinov N., and Lavrik O. (2016) Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors: usnic acid enamines enhance the cytotoxic effect of camptothecin. Journal of Natural Products, 79, 2961-2967, IF 3.779, квартиль Q1.
9. Нилов Д.К., Тараров В.И., Куликов А.В., Захаренко А.Л., Гущина И.В., Михайлов С.Н., Лаврик О.И., Швядас В.К. (2016) Ингибирование поли(ADP-рибозо)полимеразы метаболитом нуклеиновых кислот 7-метилгуанином. Acta Naturae, 8, 120-128, IF 1.360.

Основные доклады на конференциях:

1. Gushchina I.V., Nilov D.K., and Švedas V.K. (2019) Rational design of novel tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors as promising antitumor agents (постерный). 4-ая Российская конференция по медицинской химии (МедХим-2019) с международным участием, Екатеринбург, Россия, 9-14 июня 2019.
2. Gushchina I., Švedas V., and Nilov D. (2018) Selection of bifunctional tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 inhibitors by molecular modeling (постерный). 43-й Конгресс FEBS, Прага, Чехия, 7-12 июля
3. Gushchina I.V., Nilov D.K., Zakharenko A.L., Lavrik O.I., and Švedas V.K. (2015) Molecular model of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 for a structure-based screening for its inhibitors (постерный). Moscow Conference on Computational Molecular Biology (MCCMB'15), Москва, Россия, 16-19 июля 2015.

Участие в грантах:

1. Грант РФФИ 18-315-00389 мол_а «Конструирование ингибиторов тирозил-ДНК-фосфодиэстеразы и поли(АДФ-рибозо)полимеразы на основе новых молекулярных фрагментов», 2018-2019 гг (Руководитель)
2. Грант РНФ 19-74-10072 «Противоопухолевые свойства метаболитов нуклеиновых кислот, подавляющих активность поли(ADP-рибозо)полимераз», 2019-2022 гг (Ответственный исполнитель)
3. Грант РНФ 15-14-00069 «Изучение особенностей структурной организации центров связывания в ферментах патогенов и разработка новых антибиотиков для лечения заболеваний нижних дыхательных путей с использованием системных подходов биоинформатики и молекулярного моделирования», 2018-2019 гг (Исполнитель)
4. Грант РФФИ 17-08-01614 а «Конструирование и испытание ингибиторов ферментов метаболизма ДНК и гликолиза в опухолевых клетках», 2017-2019 гг (Исполнитель)
5. Грант РФФИ 17-00-00132 комфи «Механизмы узнавания повреждений ДНК в хроматине белками семейства PARP», 2017-2019 гг (Исполнитель)
6. Грант Президента РФ для молодых ученых МК-7630.2016.4 «Исследование механизмов взаимодействия новых ингибиторов репарации ДНК с белковыми мишенями и оптимизация их структуры», 2016-2017 гг (Исполнитель)
7. Грант РФФИ 14-08-01251 a «Поиск ингибиторов изоформы А лактатдегидрогеназы в опухолевых клетках с помощью методов молекулярного моделирования и экспериментальных подходов», 2014-2016 гг (Исполнитель)