Polina K.

опытный биоинформатик

Биоинформатик. Работа удаленно: анализ NGS (WGS, таргетные панели, RNA-seq, small RNA etc.), разработка и настройка пайплайнов (snakemake, docker), анализ данных, в том числе базовый ML (pytorch). Специализируюсь на биомеде.

Последнее обновление резюме 24.09.2021
Адрес Санкт-Петербург, Russian Federation
Электронная почта Заблокировано
Телефон Заблокировано

Опыт

Институт акушерства, гинекологии и репродуктологии им. Отта
биоинформатик
Мар 2019 - Текущий
Работа с NGS, анализ публичных данных, разработка БД.
ФГБНУ ВНИИСХМ
младший научный сотрудник
Янв 2019 - Текущий
Анализ транскриптомных данных, сборка транскриптома де ново, многофакторный статистический анализ
ООО НИПТ
инженер-биоинформатик
Июн 2017 - Текущий
Разработка пайплайнов для неинвазивной пренатальной диагностики, анализ WGS, таргетных панелей и клинически значимых вариантов.
West Virginia University
Research scholar
Фев 2012 - Ноя 2014
Wet lab project on migration of metastatic cells.

Образование

ФПМИ МФТИ
Курс Deep Learning по нейросетевым технологиям
Фев 2020 - Июл 2020
Повышение квалификации в области машинного обучения, полугодовой курс по нейросеткам глубокого обучения.
Институт Биоинформатики
Биоинформатика
Сен 2016 - Сен 2017
Повышение квалификации в области биоинформатики (1 год), профильные курсы с сертификатом от Академического Университета СПб
https://bioinf.me/
Санкт-Петербургский Государственный Университет
Молекулярная биология
Сен 2003 - Июл 2009
Дипломы бакалавра и магистра в СПбГУ, Биолого-почвенный факультет , кафедра Цитологии и гистологии

В чем вы сильны?

Медецинская генетика, молекулярная биология, понимание методов мокрой лаборатории.

Навыки: python, snakemake, R, command line linux, docker

Свободный английский (письменный и разговорный) - 2,5 года опыта жизни и работы в США, в университете Западной Вирджинии.

Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби

Мои публикации

Первый автор и разработчик зарегистрированного патента на изобретение "Способ неинвазиваного пренатального скрининга анеуплоидий плода", а также зарегистрированной базы данных "База данных миРНК для аннотации и интерпретации молекулярно-генетических исследований при акушерских и гинекологических заболеваниях" (PregMIR)