Евгений А.
PhD в клеточной биологи, ngs биоинформатикИщу интересную, постоянную работу в лаборатории или в компании с сильным коллективом и адекватной зп. Идеальным вижу место, где совмещается эксперементальная и биоинформатичекая работа.
Последнее обновление резюме | 21.04.2019 |
Адрес | Moscow, Russian Federation |
Электронная почта | Заблокировано |
Опыт
Биоинформатик-аналитик
Лаборант исследователь
Образование
PhD student in Dresden international PhD program
студент на кафедре физиологии человека и животных
В чем вы сильны?
Окончив МГУ и получив PhD в сильной международной программе имею обширный практический опыт работы в биологической лаборатории. В процессе выполнения PhD проекта, заинтересовался анализом ngs данных и после аспирантуры работаю в данной области
Работа с клеточными культурами. Опыт работы 6 лет. Работа со стандартными линиями (NIH3t3, NIH3t3L1, Hela, Hek293, Drosophila S2 cell line, Drosophila cl8 cell line) - поддержка, выведение стабильных линий (трансфекция, трансдукция, клональные популяции). Дифференцировка клеток. FACS (базовые умения).
Скриннинговые эксперименты. В рамках PhD проекта разработал и протестировал клеточную систему для HTS исследований Hedgehog сигналлинга.
Микроскопия. Конфокальный микроскоп, работа с флуоресцентными генетически кодируемыми сенсорами HyPer, SmoIP. ICH, IHC, live-cell imaging (изучение миграции клеток).
Молекулярная биология. Выявление сайтов связывания белков с ДНК посредством DamID метода с последующей детекцией сигнала с помощью NGS. Проводил эксперименты как в клеточных культурах так и in-vivo (Дрозофила). Исследование транскриптома методом RNAseq.
Стандартные лабораторные методики. Обширный опыт молекулярного клонирования, выделения ДНК/РНК из клеток/тканей, PCR, qrtPCR. Базовые навыки вестрн-блот, IP.
Биоинформатика. Phyton, R, основы bash, стандартные биоинформатические инструменты (QC, выравнивание, диффэкспрессия, SNP, CNV).
Анализ NGS данных. Анализ DamID, RNAseq и HTS данных для PhD проекта. Анализ RNAseq, WES данных в последующей работе.
Расскажите о себе что-нибудь еще: публикации, конференции, хобби
Публикации
Albert, E.A., Puretskaia, O.A., Terekhanova, N.V., Labudina, A., Bökel, C. (2018) Micromanagment of stem cell proliferation by the Drosophila testis stem cell niche. Dev 10.1242/dev.156315
Evgenii A Albert, Christian Boekel. (2017) A cell based, high throughput assay for quantitative analysis of Hedgehog pathway activation using a Smoothened phosphorylation sensor. Sci Rep 7(1):14341
Elena V. Poddubskaya, Madina P. Baranova, Daria O. Allina, Philipp Y. Smirnov, Eugene A. Albert, Alexey P. Kirilchev, Alexey A. Aleshin, Marina I. Sekacheva, and Maria V. Suntsova (2018) Personalized prescription of tyrosine kinase inhibitors in unresectable metastatic cholangiocarcinoma. Exp Hematol Oncol. 10.1186/s40164-018-0113-x
Pyotr A. Tyurin-Kuzmin ,Nadezhda D. Zhdanovskaya ,Anna A. Sukhova,George D. Sagaradze, Eugene A. Albert, Ludmila V. Ageeva, George V. Sharonov, Alexander V. Vorotnikov , Vsevolod A. Tkachuk. (2016) Nox4 and Duox1/2 Mediate Redox Activation of Mesenchymal Cell Migration by PDGF. PLoS ONE 11(4):e0154157
A. Shchelkunova E. A. Albert I. A. Morozov P. M. Rubtsov L. M. Samokhodskaya I. A. Sobenin A. N. Orekhov A. N. Smirnov (2011) Contents of mRNAs encoding endosome/lysosome components in normal human aorta and in stage II of atherogenesis: a hidden regulation. Biochemistry (Moscow) 76: 1178.
Хобби
Горный туризм (больше 15 лет), альпинизм, скалолазание