Группа эпигенетической эпидемиологии НИИ ФХБ им.А.Н.Белозерского МГУ, держатель гранта РНФ в 2021-2022 гг, ищет лидера команды биоинформатиков для задач гранта. Этот проект является продолжением предыдущего исследования. Руководитель проекта — Олег Сергеев, MD, PhD.

Цель проекта — изучить изменения эпигенетических маркеров, включая профиль фрагментов транспортной и рибосомальной РНК в сперматозоидах крыс и людей при воздействии возраста (крысы), характеристик пубератного периода и гормонального профиля (люди), а также при действии химических экспозиций хлорорганическими соединениями, свинцом и фталатами (люди) и ингибиторами горения (крысы). 

Задачи для сотрудника:

• На основании современной литературы разработка пайплайна для анализа NGS данных (NextSeq 500, библиотеки NEBNext и NextFlex) малой РНК, особенно для фрагментов тРНК и рРНК.
• Поиск наилучших подходов анализа фрагментов тРНК и рРНК.
• Постановка задач для других биоинформатиков команды.
• Подготовка статьи биоинформатической направленности с первым авторством.

В последующем (при пролонгации сотрудничества) – участие в разработке биостатистических и биоинформатических подходов для поиска зависимости профиля экспрессии малых РНК от интересуемых предикторов (возраст, характеристики пубертата, уровень гормонов, химические токсиканты).

• Опыт в анализе NGS данных малой РНК
• Знание английского и русского языка на уровне возможности вести обсуждение в международной команде и самостоятельного написания публикаций
• Навыки разработки собственных пайплайнов
• Соблюдение конфиденциальности и биоэтики
• Вакцинация от COVID-19 :)