ФГБУ "НМИЦ радиологии" Минздрава России - федеральное государственное бюджетное учреждение, научное и клиническое объединение трёх медицинских центров: МНИОИ им. П.А. Герцена, МРНЦ им. А.Ф. Цыба и НИИ урологии и интервенционной радиологии им. Н.А. Лопаткина.

Центр имеет в арсенале все виды современных лучевых установок, в том числе – гамма и кибер- ножи, первый отечественный протонный ускоритель «Прометеус», а также передовые технологии, такие как: хайпек (HIPEC) и пайпек (PIPAC), рентгенохирургические методы лечения, радионуклидную и брахи- терапии и многое другое. Крупнейший онкологический центр в Европе.

Молекулярно-генетическая служба Центра проводит весь спектр современного генетического тестирования, что позволяет предсказывать наследственные формы рака, а также разрабатывать программу их профилактики и лечения.

Мы в поиске сотрудника на должность Руководитель отдела Биоинформатики и Биостатистики

В обязанности будет входить:

• Управление командой из 5 человек (биоинформатики, специалисты в области машинного обучения)
•  Проведение обучения команды 
•  Формирование технических заданий для смежных подразделений, а также приемка результатов их работы 
•  Регулярная презентация результатов работы отдела 
•  Участие в общих встречах компании, формировании стратегии развития проекта. 

• Совершенствование биоионформатических пайплайнов обработки данных:

1. Соматический пайплайн
2. Герминальный пайплайн
3. Транскриптомный пайплайн
4. Метагеномный пайплайн
5. Другие

• Участие в написании научных статей в рейтинговых журналах (Q1-Q2).
• Активное участие в научных мероприятиях института.

• Опыт управления командой разработки и биоинформатики
•  Опыт обработки данных NGS
•  Опыт разработки решений в области метагеномного анализа микробиома
•  Опыт работы с Python3 от 1 года. Знание библиотек biopython, pandas, numpy, sklearn/pytorch
• Опыт работы с git, наличие проектов на GitHub\GitLab
•  Знания в области алгоритмов машинного обучения, умение применять их непосредственно к практическим задачам
• Знание математической статистики и инструментов по её применению (R, python)
•  Умение концентрироваться и анализировать большие объемы данных
•  Умение приоритизировать задачи и выстраивать эффективную работу в условиях сжатых сроков

БУДЕТ ПЛЮСОМ:

•   Опыт поддержки репозиториев в команде из нескольких человек
•    Наличие кандидатской степени или магистерского диплома
•    Знание биологии, биологическое или медицинское образование
•    Опыт работы по Agile-методологиям 

• Официальное трудоустройство по ТК РФ
•  Заработная плата по итогам собеседования, премии по результатам выполнения проектов.
•  График full-time, возможность гибкого графика и работы удаленно (частично)